BTS(バグトラッキングシステム)、Wiki、ソース管理ブラウザ(ソース管理はSubversionが行う)を統合した「Trac」というフリーのシステムがあるみたい。
Tracのサイト

オープンソースのNamazuの開発でも採用されてるみたいなので、見てみるとどんなものかわかるかも。
タイムラインはちょっと便利かも。